| Unidad Organizativa | Nivel |
| SUBSECRETARIA DE COMUNICACION INSTITUCIONAL |
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| DIRECCION GENERAL DE PRENSA Y COMUNICACION |
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| COORDINACION DE COMUNICACION | IV |
| SECRETARIA DE AGRICULTURA, GANADERIA Y PESCA |
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| COORDINACION DE WARRANTS Y CERTIFICADOS DE DEPOSITO | IV |
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| SUBSECRETARIA DE AGRICULTURA |
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| DIRECCION NACIONAL DE PRODUCCION AGRICOLA Y FORESTAL |
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| COORDINACION DE TABACO | IV |
| DIRECCION DE CULTIVOS EXTENSIVOS | III |
| DIRECCION DE CULTIVOS INTENSIVOS | III |
| DIRECCION DE PRODUCCION FORESTAL | III |
| DIRECCION NACIONAL DE INFORMACION Y MERCADOS |
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| DIRECCION DE INFORMACION AGROPECUARIA Y FORESTAL | III |
| COORDINACION TECNICO ADMINISTRATIVA | IV |
| DIRECCION DE MERCADOS AGRICOLAS | III |
| SUBSECRETARIA DE GANADERIA |
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| DIRECCION NACIONAL DE PRODUCCION GANADERA |
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| DIRECCION DE GANADERIA BOVINA | III |
| DIRECCION DE EQUINOS | III |
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| DIRECCION NACIONAL DE ESTUDIOS Y ANALISIS ECONOMICO DEL SECTOR PECUARIO |
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| DIRECCION DE ANALISIS ECONOMICO PECUARIO | III |
| SUBSECRETARIA DE LECHERIA |
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| DIRECCION NACIONAL DE PRODUCCION LECHERA |
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| DIRECCION DE LECHERIA | III |
| DIRECCION NACIONAL DE PLANIFICACION ESTRATEGICA SECTORIAL |
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| DIRECCION DE IMPLEMENTACION DE ESTRATEGIA SECTORIAL | III |
| SUBSECRETARIA DE PESCA Y ACUICULTURA |
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| DIRECCION NACIONAL DE COORDINACION PESQUERA |
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| COORDINACION DE ANALISIS DE INFRACCIONES Y SANCIONES | IV |
| COORDINACION DE CERTIFICACION DE CAPTURAS Y EXPORTACIONES | IV |
| DIRECCION DE CONTROL Y FISCALIZACION | III |
| REGISTRO DE LA PESCA | III |
| DIRECCION DE ADMINISTRACION PESQUERA | III |
| DIRECCION NACIONAL DE PLANIFICACION PESQUERA |
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| COORDINACION DE GESTION DE PESQUERIAS | IV |
| DIRECCION DE ACUICULTURA | III |
| DIRECCON DE ECONOMIA PESQUERA | III |
| DIRECCION DE PESCA CONTINENTAL | III |
| SUBSECRETARIA DE AGREGADO DE VALOR Y NUEVAS TECNOLOGIAS |
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| DIRECCION NACIONAL DE PROCESOS Y TECNOLOGIAS |
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| COORDINACION DE GESTION AMBIENTAL | IV |
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| DIRECCION DE FINANCIAMIENTO | II |
| DIRECCION DE BIOTECNOLOGIA | II |
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| SECRETARIA DE DESARROLLO RURAL Y AGRICULTURA FAMILIAR |
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| SUBSECRETARIA DE DESARROLLO DE ECONOMIAS REGIONALES |
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| DIRECCION NACIONAL DE DESARROLLO TERRITORIAL RURAL |
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| DIRECCION DE GESTION TERRITORIAL | III |
| DIRECCION DE EJECUCION DE PROGRAMAS Y PROYECTOS DESTINADOS A PEQUEÑOS PRODUCTORES | III |
| DIRECCION NACIONAL DE PROGRAMAS DE DESARROLLO REGIONAL |
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| DIRECCION DE PROGRAMACION PARA EL DESARROLLO | III |
| DIRECCION DE COMPETITIVIDAD E INCLUSION DE PEQUEÑOS PRODUCTORES | III |
| SUBSECRETARIA DE AGRICULTURA FAMILIAR |
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| DIRECCION NACIONAL DE EJECUCION DE PROGRAMAS PARA LA AGRICULTURA FAMILIAR |
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| DIRECCION DE PROGRAMAS Y PROYECTOS PARA LA AGRICULTURA FAMILIAR | III |
| DIRECCION DE PROYECTOS ESPECIALES DE LA AGRICULTURA FAMILIAR | III |
| DIRECCION NACIONAL DE FORTALECIMIENTO INSTITUCIONAL |
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| DIRECCION DE APOYO A LAS ORGANIZACIONES DE LA AGRICULTURA FAMILIAR | III |
| DIRECCION DE CAPACITACION Y ASISTENCIA TECNICA | III |
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| REGISTRO NACIONAL DE LA AGRICULTURA FAMILIAR | III |
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| SECRETARIA DE COORDINACION POLITICO INSTITUCIONAL Y EMERGENCIA AGROPECUARIA |
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| DIRECCION NACIONAL DE EMERGENCIAS Y DESASTRES AGROPECUARIOS |
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| DIRECCION DE EMERGENCIA AGROPECUARIA | III |
| DIRECCION DE CRISIS Y ASISTENCIA AGROPECUARIA | III |
| DIRECCION DE INSTRUMENTOS IMPOSITIVOS, FINANCIEROS Y FISCALES | III |
| SUBSECRETARIA DE COORDINACION POLITICA |
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| DIRECCION NACIONAL DE RELACIONES AGROALIMENTARIAS INTERNACIONALES |
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| COORDINACION DE APOYO A LAS NEGOCIACIONES Y CONSEJERIAS AGRICOLAS | IV |
| DIRECCION DE COOPERACION Y NEGOCIACIONES BILATERALES | III |
| DIRECCION DE NEGOCIACIONES MULTILATERALES | III |
| DIRECCION DE NEGOCIACIONES REGIONALES Y CONTROVERSIAS | III |
| SUBSECRETARIA DE COORDINACION INSTITUCIONAL |
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| DIRECCION NACIONAL DE RELACIONES CON PROVINCIAS, MUNICIPIOS Y ORGANIZACIONES NO GUBERNAMENTALES |
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| DIRECCION DE VINCULACION CON PROVINCIAS, MUNICIPIOS Y ORGANIZACIONES NO GUBERNAMENTALES | III |
| COORDINACION DE EVENTOS Y FIESTAS POPULARES | IV |
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| DIRECCION NACIONAL DE RELACIONES PARLAMENTARIAS E INTERMINISTERIALES |
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| DIRECCION DE RELACIONES PARLAMENTARIAS | III |
| DIRECCION DE RELACIONES INTERMINISTERIALES | III |